دانشگاه دولتی سن پترزبورگ  در دو پردیس اصلی واقع شده است: در جزیره واسیلوسکی (Vasilievsky) در مرکز شهر و در پیتروف (Peterhof) یا همان پترودورتس سابق(Petrodvorets)، در حومۀ جنوب غربی که از طریق راه آهن از پایانه بالتی اسکای ریل (Baltiysky Rail Terminal) قابل دسترس است.

توالو کالجیا (Twelve Collegia) ساختمان اصلی دانشگاه است که در جزیره واسیلوسکی قرار دارد و شامل کتابخانه، دانشکده زیست شناسی و موسسه علوم زمین است. دانشکده زبان شناسی و دانشکده مطالعات شرقی، به صورت مشترک از ساختمان قرن هجدهمی پترین باروک (Petrine Baroque) که در نزدیکی دیواره یونیورسیتی تسکایا (Universitetskaya) بولشایای نوا (Bolshaya Neva) قرار دارد، استفاده می کنند.

این سازه توسط دومنیکو ترزینی طراحی شده و در اصل کاخ پیتر دوم روسیه بوده است. دانشکده روانشناسی در مقابل آن در دیواره آدمیرال ماکاروفِ مالایا نوا واقع شده است. دانشکده تحصیلات عالی مدیریت، دانشکده روزنامه نگاری و ارتباطات جمعی، دانشکده پزشکی، دانشکده دندانپزشکی و فن آوری های پزشکی، دانشکده حقوق و دانشکده مطالعات نظامی، همه در جزیره واسیلوسکی قرار دارند. چهار دانشکده علوم اجتماعی دیگر در شرق مرکز شهر در جنوب نوا قرار دارند: دانشکده اقتصاد در نزدیکی ایستگاه متروی چرنی شوسکیا (Chernyshevskaya) واقع شده است، و دانشکده جامعه شناسی، دانشکده علوم سیاسی و دانشکده روابط بین الملل در ساختمان های تاریخی اسمولنی کونونت (Smolny Convent) واقع شده اند.

پردیس جدید حومه جنوبی شامل دانشکده ریاضیات کاربردی و فرآیندهای کنترل، موسسه شیمی، دانشکده ریاضی و مکانیک و دانشکده فیزیک است که در ساختمان های مدرن در پیتروف واقع شده اند. در نزدیکی پردیس پیتروف یک پارک زیبا به نام سرجیوکا (Sergievka) وجود دارد. در این پارک، ساختمان دانشکده زیست شناسی قرار دارد. یکی از مناظر پارک سرجیوکا تندیس سنگی سر یک قهرمان است.